A composição da modelagem espacial também está diretamente relacionada à disponibilidade e planejamento da gestão dos recursos hídricos, necessário ao desenvolvimento sustentável do Polo Industrial de Camaçari. Da mesma forma que o aquifero São Sebastião foi determinante para a decisão locacional do Copec, ele representa hoje um recurso importante para a manutenção e desenvolvimento de diversas tipologias industriais. Além disso, o desbalanceamento hídrico provocado pela superexplotação de águas subterrâneas em algumas áreas do Polo, que causaram inclusive riscos de contaminação do lençol, remonta a necessidade de incorporar no plano de acondicionamento territorial o Zoneamento de Gestão de Recursos Hídricos Subterrâneos, que assim está definido:
ZONA HÍDRICA 01 - ZH1: Zona com potencial de explotação de água subterrânea;
ZONA HÍDRICA 02 - ZH2: Zona com explotação parcial, passível de ampliação;
ZONA HÍDRICA 03 - ZH3: Zona de controle e redução de explotação de águas subterrâneas por condição de superexplotação;
ZONA HÍDRICA 04 - ZH4: Zona não passível de explotação de águas subterrâneas por superexplotação e riscos de contaminação por atividades industriais da petroquímica;
ZONA HÍDRICA 05 - ZH5: Zona com explotação parcial, passível de ampliação;
ZONA HÍDRICA 06 - ZH6: Zona não passível de explotação de águas subterrâneas por riscos de contaminação causado pela concentração de efluentes líquidos na ETE;
ZONA HÍDRICA 07 – ZH7: Zona com potencial de explotação de água a partir de águas subterrâneas;
ZONA HÍDRICA 08 – ZH8: Zona reservada para abastecimento futuro a partir de aquifero subterrâneo e de explotação estratégica de água superficial a partir da Represa Santa Helena;

